Program PWSCF v.5.3.0 (svn rev. 11974) starts on 1Feb2017 at 9:19:48
This program is part of the open-source Quantum ESPRESSO suite
for quantum simulation of materials; please cite
"P. Giannozzi et al., J. Phys.:Condens. Matter 21 395502 (2009);
URL http://www.quantum-espresso.org",
in publications or presentations arising from this work. More details at
http://www.quantum-espresso.org/quote
Parallel version (MPI), running on 72 processors
R & G space division: proc/nbgrp/npool/nimage = 72
Waiting for input...
Reading input from standard input
Current dimensions of program PWSCF are:
Max number of different atomic species (ntypx) = 10
Max number of k-points (npk) = 40000
Max angular momentum in pseudopotentials (lmaxx) = 3
file Sn.rel-pbe-dn-rrkjus_psl.1.0.0.UPF: wavefunction(s) 5S 4D 4D renormalized
Subspace diagonalization in iterative solution of the eigenvalue problem:
one sub-group per k-point group (pool) will be used
scalapack distributed-memory algorithm (size of sub-group: 6* 6 procs)
Parallelization info
--------------------
sticks: dense smooth PW G-vecs: dense smooth PW
Min 51 39 10 3155 2110 304
Max 52 40 11 3165 2142 315
Sum 3717 2849 785 227481 152941 22431
bravais-lattice index = 14
lattice parameter (alat) = 14.5112 a.u.
unit-cell volume = 3405.7026 (a.u.)^3
number of atoms/cell = 20
number of atomic types = 3
number of electrons = 148.00
number of Kohn-Sham states= 178
kinetic-energy cutoff = 48.0000 Ry
charge density cutoff = 250.0000 Ry
convergence threshold = 1.0E-08
mixing beta = 0.7000
number of iterations used = 8 plain mixing
Exchange-correlation = PBE ( 1 4 3 4 0 0)
Non magnetic calculation with spin-orbit
celldm(1)= 14.511206 celldm(2)= 0.886834 celldm(3)= 1.524417
celldm(4)= 0.565975 celldm(5)= 0.000000 celldm(6)= 0.000000
crystal axes: (cart. coord. in units of alat)
a(1) = ( 1.000000 0.000000 0.000000 )
a(2) = ( 0.000000 0.886834 0.000000 )
a(3) = ( 0.000000 0.862782 1.256764 )
reciprocal axes: (cart. coord. in units 2 pi/alat)
b(1) = ( 1.000000 -0.000000 -0.000000 )
b(2) = ( 0.000000 1.127606 -0.774113 )
b(3) = ( 0.000000 0.000000 0.795694 )
PseudoPot. # 1 for Sn read from file:
/users/gautes/Pseudo/Sn.rel-pbe-dn-rrkjus_psl.1.0.0.UPF
MD5 check sum: 9499e19b89e678f7f9f46ad7de03aa82
Pseudo is Ultrasoft + core correction, Zval = 14.0
Generated using "atomic" code by A. Dal Corso v.5.0.2 svn rev. 9656
Using radial grid of 1243 points, 10 beta functions with:
l(1) = 0
l(2) = 0
l(3) = 1
l(4) = 1
l(5) = 1
l(6) = 1
l(7) = 2
l(8) = 2
l(9) = 2
l(10) = 2
Q(r) pseudized with 0 coefficients
PseudoPot. # 2 for Se read from file:
/users/gautes/Pseudo/Se.rel-pbe-n-rrkjus_psl.1.0.0.UPF
MD5 check sum: 38611c150961c07dbd63be353364166d
Pseudo is Ultrasoft + core correction, Zval = 6.0
Generated using "atomic" code by A. Dal Corso v.5.0.2 svn rev. 9656
Using radial grid of 1211 points, 6 beta functions with:
l(1) = 0
l(2) = 0
l(3) = 1
l(4) = 1
l(5) = 1
l(6) = 1
Q(r) pseudized with 0 coefficients
PseudoPot. # 3 for P read from file:
/users/gautes/Pseudo/P.rel-pbe-n-rrkjus_psl.1.0.0.UPF
MD5 check sum: 667ec27f6326587e4f0d1734a2230026
Pseudo is Ultrasoft + core correction, Zval = 5.0
Generated using "atomic" code by A. Dal Corso v.5.0.2 svn rev. 9656
Using radial grid of 1147 points, 10 beta functions with:
l(1) = 0
l(2) = 0
l(3) = 1
l(4) = 1
l(5) = 1
l(6) = 1
l(7) = 2
l(8) = 2
l(9) = 2
l(10) = 2
Q(r) pseudized with 0 coefficients
atomic species valence mass pseudopotential
Sn 14.00 118.71000 Sn( 1.00)
Se 6.00 78.96000 Se( 1.00)
P 5.00 30.97380 P( 1.00)
2 Sym. Ops., with inversion, found
(note: 2 additional sym.ops. were found but ignored
their fractional translations are incommensurate with FFT grid)
s frac. trans.
isym = 1 identity
cryst. s( 1) = ( 1 0 0 )
( 0 1 0 )
( 0 0 1 )
cart. s( 1) = ( 1.0000000 0.0000000 -0.0000000 )
( 0.0000000 1.0000000 0.0000000 )
( 0.0000000 0.0000000 1.0000000 )
isym = 2 inversion
cryst. s( 2) = ( -1 0 0 )
( 0 -1 0 )
( 0 0 -1 )
cart. s( 2) = ( -1.0000000 0.0000000 0.0000000 )
( 0.0000000 -1.0000000 -0.0000000 )
( 0.0000000 0.0000000 -1.0000000 )
double point group C_i (-1)
there are 4 classes and 2 irreducible representations
the character table:
E -E i -i
G_2+ 1.00 -1.00 1.00 -1.00
G_2- 1.00 -1.00 -1.00 1.00
the symmetry operations in each class and the name of the first element:
E 1
identity
-E -1
identity E
i 2
inversion
-i -2
inversion E
Cartesian axes
number of k points= 31 Fermi-Dirac smearing, width (Ry)= 0.0010
cart. coord. in units 2pi/alat
k( 1) = ( 0.0000000 0.0000000 0.0000000), wk = 0.0166667
k( 2) = ( 0.0000000 0.0000000 0.2652314), wk = 0.0333333
k( 3) = ( 0.0000000 0.2255213 -0.1548227), wk = 0.0333333
k( 4) = ( 0.0000000 0.2255213 0.1104087), wk = 0.0333333
k( 5) = ( 0.0000000 0.2255213 -0.4200541), wk = 0.0333333
k( 6) = ( 0.0000000 0.4510426 -0.3096454), wk = 0.0333333
k( 7) = ( 0.0000000 0.4510426 -0.0444140), wk = 0.0333333
k( 8) = ( 0.0000000 0.4510426 -0.5748768), wk = 0.0333333
k( 9) = ( 0.2500000 -0.0000000 -0.0000000), wk = 0.0333333
k( 10) = ( 0.2500000 -0.0000000 0.2652314), wk = 0.0333333
k( 11) = ( 0.2500000 0.2255213 -0.1548227), wk = 0.0333333
k( 12) = ( 0.2500000 0.2255213 0.1104087), wk = 0.0333333
k( 13) = ( 0.2500000 0.2255213 -0.4200541), wk = 0.0333333
k( 14) = ( 0.2500000 0.4510426 -0.3096454), wk = 0.0333333
k( 15) = ( 0.2500000 0.4510426 -0.0444140), wk = 0.0333333
k( 16) = ( 0.2500000 0.4510426 -0.5748768), wk = 0.0333333
k( 17) = ( -0.5000000 0.0000000 0.0000000), wk = 0.0166667
k( 18) = ( -0.5000000 0.0000000 0.2652314), wk = 0.0333333
k( 19) = ( -0.5000000 0.2255213 -0.1548227), wk = 0.0333333
k( 20) = ( -0.5000000 0.2255213 0.1104087), wk = 0.0333333
k( 21) = ( -0.5000000 0.2255213 -0.4200541), wk = 0.0333333
k( 22) = ( -0.5000000 0.4510426 -0.3096454), wk = 0.0333333
k( 23) = ( -0.5000000 0.4510426 -0.0444140), wk = 0.0333333
k( 24) = ( -0.5000000 0.4510426 -0.5748768), wk = 0.0333333
k( 25) = ( 0.2500000 -0.0000000 -0.2652314), wk = 0.0333333
k( 26) = ( 0.2500000 -0.2255213 0.1548227), wk = 0.0333333
k( 27) = ( 0.2500000 -0.2255213 -0.1104087), wk = 0.0333333
k( 28) = ( 0.2500000 -0.2255213 0.4200541), wk = 0.0333333
k( 29) = ( 0.2500000 -0.4510426 0.3096454), wk = 0.0333333
k( 30) = ( 0.2500000 -0.4510426 0.0444140), wk = 0.0333333
k( 31) = ( 0.2500000 -0.4510426 0.5748768), wk = 0.0333333
cryst. coord.
k( 1) = ( 0.0000000 0.0000000 0.0000000), wk = 0.0166667
k( 2) = ( 0.0000000 0.0000000 0.3333333), wk = 0.0333333
k( 3) = ( 0.0000000 0.2000000 -0.0000000), wk = 0.0333333
k( 4) = ( 0.0000000 0.2000000 0.3333333), wk = 0.0333333
k( 5) = ( 0.0000000 0.2000000 -0.3333333), wk = 0.0333333
k( 6) = ( 0.0000000 0.4000000 -0.0000000), wk = 0.0333333
k( 7) = ( 0.0000000 0.4000000 0.3333333), wk = 0.0333333
k( 8) = ( 0.0000000 0.4000000 -0.3333333), wk = 0.0333333
k( 9) = ( 0.2500000 0.0000000 0.0000000), wk = 0.0333333
k( 10) = ( 0.2500000 0.0000000 0.3333333), wk = 0.0333333
k( 11) = ( 0.2500000 0.2000000 -0.0000000), wk = 0.0333333
k( 12) = ( 0.2500000 0.2000000 0.3333333), wk = 0.0333333
k( 13) = ( 0.2500000 0.2000000 -0.3333333), wk = 0.0333333
k( 14) = ( 0.2500000 0.4000000 0.0000000), wk = 0.0333333
k( 15) = ( 0.2500000 0.4000000 0.3333333), wk = 0.0333333
k( 16) = ( 0.2500000 0.4000000 -0.3333333), wk = 0.0333333
k( 17) = ( -0.5000000 0.0000000 -0.0000000), wk = 0.0166667
k( 18) = ( -0.5000000 0.0000000 0.3333333), wk = 0.0333333
k( 19) = ( -0.5000000 0.2000000 0.0000000), wk = 0.0333333
k( 20) = ( -0.5000000 0.2000000 0.3333333), wk = 0.0333333
k( 21) = ( -0.5000000 0.2000000 -0.3333333), wk = 0.0333333
k( 22) = ( -0.5000000 0.4000000 -0.0000000), wk = 0.0333333
k( 23) = ( -0.5000000 0.4000000 0.3333333), wk = 0.0333333
k( 24) = ( -0.5000000 0.4000000 -0.3333333), wk = 0.0333333
k( 25) = ( 0.2500000 0.0000000 -0.3333333), wk = 0.0333333
k( 26) = ( 0.2500000 -0.2000000 -0.0000000), wk = 0.0333333
k( 27) = ( 0.2500000 -0.2000000 -0.3333333), wk = 0.0333333
k( 28) = ( 0.2500000 -0.2000000 0.3333333), wk = 0.0333333
k( 29) = ( 0.2500000 -0.4000000 0.0000000), wk = 0.0333333
k( 30) = ( 0.2500000 -0.4000000 -0.3333333), wk = 0.0333333
k( 31) = ( 0.2500000 -0.4000000 0.3333333), wk = 0.0333333
Dense grid: 227481 G-vectors FFT dimensions: ( 75, 72, 120)
Smooth grid: 152941 G-vectors FFT dimensions: ( 72, 60, 100)
Largest allocated arrays est. size (Mb) dimensions
Kohn-Sham Wavefunctions 1.48 Mb ( 544, 178)
NL pseudopotentials 1.83 Mb ( 272, 440)
Each V/rho on FFT grid 0.16 Mb ( 10800)
Each G-vector array 0.02 Mb ( 3161)
G-vector shells 0.02 Mb ( 3075)
Largest temporary arrays est. size (Mb) dimensions
Auxiliary wavefunctions 5.91 Mb ( 544, 712)
Each subspace H/S matrix 0.21 Mb ( 118, 118)
Each <psi_i|beta_j> matrix 2.39 Mb ( 440, 2, 178)
Arrays for rho mixing 1.32 Mb ( 10800, 8)
Initial potential from superposition of free atoms
starting charge 147.99409, renormalised to 148.00000
Starting wfc are 200 randomized atomic wfcs
total cpu time spent up to now is 14.8 secs
per-process dynamical memory: 104.6 Mb
Self-consistent Calculation
iteration # 1 ecut= 48.00 Ry beta=0.70
Davidson diagonalization with overlap
ethr = 1.00E-02, avg # of iterations = 3.0
Threshold (ethr) on eigenvalues was too large:
Diagonalizing with lowered threshold
Davidson diagonalization with overlap
ethr = 3.07E-04, avg # of iterations = 5.5
total cpu time spent up to now is 88.0 secs
total energy = -957.94421461 Ry
Harris-Foulkes estimate = -958.18784738 Ry
estimated scf accuracy < 0.45148910 Ry
iteration # 2 ecut= 48.00 Ry beta=0.70
Davidson diagonalization with overlap
ethr = 3.05E-04, avg # of iterations = 3.7
total cpu time spent up to now is 128.8 secs
total energy = -958.01710117 Ry
Harris-Foulkes estimate = -958.12455728 Ry
estimated scf accuracy < 0.18621291 Ry
iteration # 3 ecut= 48.00 Ry beta=0.70
Davidson diagonalization with overlap
ethr = 1.26E-04, avg # of iterations = 2.5
total cpu time spent up to now is 164.6 secs
total energy = -958.06258774 Ry
Harris-Foulkes estimate = -958.07551636 Ry
estimated scf accuracy < 0.02577253 Ry
iteration # 4 ecut= 48.00 Ry beta=0.70
Davidson diagonalization with overlap
ethr = 1.74E-05, avg # of iterations = 6.1
total cpu time spent up to now is 211.9 secs
total energy = -958.06754455 Ry
Harris-Foulkes estimate = -958.07340450 Ry
estimated scf accuracy < 0.01373072 Ry
iteration # 5 ecut= 48.00 Ry beta=0.70
Davidson diagonalization with overlap
ethr = 9.28E-06, avg # of iterations = 4.0
total cpu time spent up to now is 251.3 secs
total energy = -958.07035695 Ry
Harris-Foulkes estimate = -958.07051124 Ry
estimated scf accuracy < 0.00038575 Ry
iteration # 6 ecut= 48.00 Ry beta=0.70
Davidson diagonalization with overlap
ethr = 2.61E-07, avg # of iterations = 2.5
total cpu time spent up to now is 287.1 secs
total energy = -958.07043938 Ry
Harris-Foulkes estimate = -958.07044789 Ry
estimated scf accuracy < 0.00002152 Ry
iteration # 7 ecut= 48.00 Ry beta=0.70
Davidson diagonalization with overlap
ethr = 1.45E-08, avg # of iterations = 3.0
total cpu time spent up to now is 324.9 secs
total energy = -958.07044428 Ry
Harris-Foulkes estimate = -958.07044809 Ry
estimated scf accuracy < 0.00000867 Ry
iteration # 8 ecut= 48.00 Ry beta=0.70
Davidson diagonalization with overlap
ethr = 5.86E-09, avg # of iterations = 3.0
total cpu time spent up to now is 361.1 secs
total energy = -958.07044586 Ry
Harris-Foulkes estimate = -958.07044799 Ry
estimated scf accuracy < 0.00000686 Ry
iteration # 9 ecut= 48.00 Ry beta=0.70
Davidson diagonalization with overlap
ethr = 4.63E-09, avg # of iterations = 2.0
total cpu time spent up to now is 393.7 secs
total energy = -958.07044699 Ry
Harris-Foulkes estimate = -958.07044706 Ry
estimated scf accuracy < 0.00000031 Ry
iteration # 10 ecut= 48.00 Ry beta=0.70
Davidson diagonalization with overlap
ethr = 2.11E-10, avg # of iterations = 3.0
total cpu time spent up to now is 429.9 secs
total energy = -958.07044707 Ry
Harris-Foulkes estimate = -958.07044707 Ry
estimated scf accuracy < 0.00000003 Ry
iteration # 11 ecut= 48.00 Ry beta=0.70
Davidson diagonalization with overlap
ethr = 1.76E-11, avg # of iterations = 3.0
total cpu time spent up to now is 467.5 secs
total energy = -958.07044707 Ry
Harris-Foulkes estimate = -958.07044708 Ry
estimated scf accuracy < 0.00000001 Ry
iteration # 12 ecut= 48.00 Ry beta=0.70
Davidson diagonalization with overlap
ethr = 9.19E-12, avg # of iterations = 2.3
total cpu time spent up to now is 501.2 secs
End of self-consistent calculation
k = 0.0000 0.0000 0.0000 ( 19123 PWs) bands (ev):
-15.4739 -15.4739 -15.4738 -15.4738 -15.4735 -15.4735 -15.4733 -15.4733
-15.4629 -15.4629 -15.4628 -15.4628 -15.4623 -15.4623 -15.4621 -15.4621
-14.4391 -14.4391 -14.4384 -14.4384 -14.4379 -14.4379 -14.4378 -14.4378
-14.4308 -14.4308 -14.4307 -14.4307 -14.4289 -14.4289 -14.4286 -14.4286
-14.4239 -14.4239 -14.4238 -14.4238 -14.4228 -14.4228 -14.4227 -14.4227
-9.2218 -9.2218 -8.9955 -8.9955 -7.9643 -7.9643 -7.9478 -7.9478
-6.6240 -6.6240 -6.6074 -6.6074 -6.5832 -6.5832 -6.4997 -6.4997
-6.3112 -6.3112 -6.2883 -6.2883 -6.2048 -6.2048 -6.1154 -6.1154
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-15.4629 -15.4629 -15.4628 -15.4628 -15.4622 -15.4622 -15.4621 -15.4621
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-15.4629 -15.4629 -15.4627 -15.4627 -15.4624 -15.4624 -15.4621 -15.4621
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9.9584 9.9584
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-15.4629 -15.4629 -15.4627 -15.4627 -15.4624 -15.4624 -15.4621 -15.4621
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-4.1931 -4.1931 -3.5385 -3.5385 -1.9398 -1.9398 -1.8857 -1.8857
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2.1310 2.1310 2.2356 2.2356 2.8042 2.8042 3.0169 3.0169
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4.1331 4.1331 4.2521 4.2521 4.3091 4.3091 4.4514 4.4514
4.5142 4.5142 4.6653 4.6653 4.7415 4.7415 4.8134 4.8134
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-15.4628 -15.4628 -15.4626 -15.4626 -15.4624 -15.4624 -15.4622 -15.4622
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-15.4629 -15.4629 -15.4626 -15.4626 -15.4624 -15.4624 -15.4621 -15.4621
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k = 0.2500-0.0000-0.2652 ( 19121 PWs) bands (ev):
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4.9985 4.9985 5.0689 5.0689 5.1736 5.1736 5.3005 5.3005
5.4252 5.4252 5.5243 5.5243 5.6620 5.6620 5.7522 5.7522
5.9092 5.9092 6.0666 6.0666 7.5861 7.5861 7.9968 7.9968
8.2264 8.2264 8.3843 8.3843 8.6015 8.6015 8.6736 8.6736
8.8473 8.8473 8.9731 8.9731 9.1199 9.1199 9.2294 9.2294
9.3625 9.3625 9.4400 9.4400 9.5040 9.5040 9.7407 9.7407
9.8831 9.8831
occupation numbers
1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000
1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000
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0.0000 0.0000
the Fermi energy is 6.9205 ev
! total energy = -958.07044707 Ry
Harris-Foulkes estimate = -958.07044708 Ry
estimated scf accuracy < 2.5E-09 Ry
The total energy is the sum of the following terms:
one-electron contribution = -289.86345714 Ry
hartree contribution = 221.77727483 Ry
xc contribution = -287.03760103 Ry
ewald contribution = -602.94666373 Ry
smearing contrib. (-TS) = 0.00000000 Ry
convergence has been achieved in 12 iterations
Writing output data file SnPSe3.save
init_run : 11.97s CPU 12.18s WALL ( 1 calls)
electrons : 482.48s CPU 486.46s WALL ( 1 calls)
Called by init_run:
wfcinit : 11.33s CPU 11.44s WALL ( 1 calls)
potinit : 0.10s CPU 0.10s WALL ( 1 calls)
Called by electrons:
c_bands : 419.79s CPU 423.09s WALL ( 13 calls)
sum_band : 60.23s CPU 60.86s WALL ( 13 calls)
v_of_rho : 0.14s CPU 0.14s WALL ( 13 calls)
v_h : 0.02s CPU 0.01s WALL ( 13 calls)
v_xc : 0.12s CPU 0.12s WALL ( 13 calls)
newd : 2.20s CPU 2.24s WALL ( 13 calls)
mix_rho : 0.10s CPU 0.11s WALL ( 13 calls)
Called by c_bands:
init_us_2 : 0.90s CPU 0.90s WALL ( 837 calls)
cegterg : 407.82s CPU 410.93s WALL ( 403 calls)
Called by sum_band:
sum_band:bec : 4.97s CPU 4.96s WALL ( 403 calls)
addusdens : 1.55s CPU 1.57s WALL ( 13 calls)
Called by *egterg:
h_psi : 265.92s CPU 269.00s WALL ( 1787 calls)
s_psi : 27.37s CPU 27.40s WALL ( 1787 calls)
g_psi : 0.39s CPU 0.38s WALL ( 1353 calls)
cdiaghg : 74.96s CPU 75.15s WALL ( 1725 calls)
cegterg:over : 18.21s CPU 18.28s WALL ( 1353 calls)
cegterg:upda : 13.38s CPU 13.30s WALL ( 1353 calls)
cegterg:last : 5.81s CPU 5.83s WALL ( 403 calls)
cdiaghg:chol : 3.80s CPU 3.77s WALL ( 1725 calls)
cdiaghg:inve : 2.86s CPU 2.93s WALL ( 1725 calls)
cdiaghg:para : 5.88s CPU 5.94s WALL ( 3450 calls)
Called by h_psi:
h_psi:vloc : 218.20s CPU 221.16s WALL ( 1787 calls)
h_psi:vnl : 46.96s CPU 47.05s WALL ( 1787 calls)
add_vuspsi : 23.86s CPU 23.91s WALL ( 1787 calls)
General routines
calbec : 31.84s CPU 31.95s WALL ( 2190 calls)
fft : 0.34s CPU 0.36s WALL ( 397 calls)
ffts : 0.07s CPU 0.08s WALL ( 104 calls)
fftw : 249.24s CPU 252.89s WALL ( 882628 calls)
interpolate : 0.16s CPU 0.17s WALL ( 104 calls)
Parallel routines
fft_scatter : 131.34s CPU 134.23s WALL ( 883129 calls)
PWSCF : 8m33.81s CPU 8m44.00s WALL
This run was terminated on: 9:28:32 1Feb2017
=------------------------------------------------------------------------------=
JOB DONE.
=------------------------------------------------------------------------------=